| 96.01.28 | 立榮航空公司於元月28日飛航馬公至韓國首爾國際包機，2月1日返回，旅客往返各151人；另於元月29日飛航馬公至香港國際包機，2月3日返回，旅客往返各118人。 |
| 96.01.30 | 審計部交通建設審計處游科長行健及陳審計育如於1月30日至2月1日蒞本站查核業務。 |
| 96.02.04 | 張局長國政於本日上午蒞本站進行春節慰問視察，由本站楊主任國峰陪同至助航台、塔台、諮詢台暨航警局馬公分駐所等駐站單位巡視，並致贈全體員工春節慰問金。 |
| 96.02.21 | 張局長國政於本日下午蒞本站慰問春節值勤人員辛勞並致送春節賀年紅包。 |
| 96.02.22 | 本站配合澎湖縣政府辦理96年春節期間聯合補位櫃檯，自2月22日至2月25日止，共辦理4天，實際補位搭機總人數1,843人，圓滿完成疏運作業。 |
| 96.03.15 | 辦理96年度夜間場內航空器失事搶救演習，由大局張局長國政主持。 |
| 96. 3.19 | 大局供應組鄭組長成豐率隊蒞七美及望安航空站實施96年度財產及物品管理與維護績效考核作業。 |
| 96.03.20 | 大局供應組鄭組長成豐率隊蒞本站實施96年度財產及物品管理與維護績效考核作業。 |
| 96.04.12 | 交通部總務司黃司長朝陽率隊蒞本站進行「清淨家園全民運動」現場訪查。 |
| 96.04.16 | 立榮航空公司辦理馬公－金門小三通首航包機，載運林立法委員炳坤、澎湖縣王縣長乾發、縣議員約15人及民眾共約128人，循小三通模式至大陸拜會及行銷澎湖旅遊，上午9時30分並於本航廈辦理馬公－金門小三通首航典禮。 |
| 96.04.26 | 大局標準組喻科長宜式率防颱檢查小組成員蒞本站實施96年度防颱措施檢查。 |
| 96.05.01 | 本站96年度飛航安全宣導週各項活動於本日至7日舉辦，由大局王副局長德和蒞站主持開幕典禮，並與高雄國立科學工藝博物館合辦「飛航科學新樂園」活動。 |
| 96.05.08 | 法務部澎湖縣調查站胡主任心毅等11人於本日下午蒞本站參訪，由 大局政風室廖主任年鋒及本站楊主任國峰帶領組室主管親自接待，並安排簡報、現場觀摩及意見交流等參訪活動。 |
| 96.05.27 | 立榮航空公司飛行馬公至日本富山包機，於5月31日返回，旅客共132人。 |
| 96.06.07 | 大局秘書室魏主任貽楙率隊至本站進行「96年度文書流程管理作業」檢核。 |
| 96.06.26 | 望安航空站舉辦96年度航空器事故災害防救演練。 |
| 96.06.27 | 七美航空站舉辦96年度空難災害防救演習。 |
| 96.07.04 | 本站榮獲交通部「清淨家園全民運動計畫」現場訪查評比第二名，楊主任國峰親往交通部接受蔡部長頒獎。 |
| 96.07.10 | 本站新網頁改版正式上線。 |
| 96.07.10 | 大局採購案件稽核小組卓技正智能等人至本站進行空調改善及大客車車道改善等採購案件稽核作業。 |
| 96.08.12 | 華信航空公司辦理馬公至香港國際包機，於8月19
日返回，旅客往返各64人。 |
| 96.08.22 | 本站及七美航空站航務員「航空氣象、簡易塔台及飛安事件訓練」，22至23日於七美航空站舉辦，總計訓練6位人員。 |
| 96.08.28 | 交通部暨所屬機關模範公務人員計31人至本站參訪。 |
| 96.09.04 | 大局企劃組楊副組長率隊至本站實施96年度為民服務績效定期評鑑。 |
| 96.09.12 | 本站及望安航空站航務員「航空氣象、簡易塔台及飛安事件訓練」，12至13日於望安航空站舉辦，總計訓練4位人員。 |
| 96.09.28 | 大陸旅客循小三通模式至澎湖旅遊，本日復興航空公司辦理金門首發團(泉州)至馬公包機，旅客68人；另立榮航空公司辦理馬祖首發團(福州)至馬公包機，旅客37人，兩團於9月30日離澎。 |
| 96.10.08 | 大局資訊室謝高級分析師其政率相關人員至本站辦理資訊安全訪查。 |
| 96.10.11 | 立法院交通委員會邀集交通部蔡部長等人至澎考察相關交通、觀光建設，由大局林副局長信得陪同。 |
| 96.10.24 | 大局資訊室張主任中權率隊至本站辦理民航事業作業基金管理系統驗收作業。 |
| 96.11.02 | 本站公共藝術-風在說話作品，參加第一屆「公共藝術獎」，經文建會評選獲「最佳人氣獎」。 |
| 96.11.05 | 大局航站管理小組趙簡任視察生帶領王科長華駿及戴技正念同至本站執行機場空側設施及作業查核。 |
| 96.12.14 | 貝爾國際驗證公司至本站進行ISO-9001：2000品質管理系統複評作業。 |
